El objetivo principal del CREAF es generar nuevos conocimientos y herramientas en el ámbito de la ecología terrestre, especialmente la forestal, para mejorar la planificación y gestión del medio natural, rural y urbano mediante:

1. Una investigación básica de excelencia, innovadora y puntera que pueda ser considerada un referente a escala nacional e internacional.
2. Una investigación aplicada, especialmente en el ámbito forestal, que contribuya a la gestión y conservación sostenibles de los recursos y de los ecosistemas.
3. El desarrollo de herramientas conceptuales y metodológicas para facilitar la toma de decisiones y mejorar la gestión del medio.
4. La difusión de todos estos conocimientos científicos y tecnológicos mediante actividades de formación, asesoramiento y divulgación.